Depuis quelques années, le Séminaire Saint-Joseph s’est doté d’un Parlement au secondaire. Appuyé par la Fondation Jean-Charles-Bonenfant de l'Assemblée nationale du Québec, le Parlement au secondaire vise à assurer la participation des élèves de tous les niveaux aux décisions touchant la vie de l'école et ainsi de vivre pleinement le processus démocratique.
Le mode de fonctionnement, s’inspirant de l’Assemblée nationale, permet aux 37 élèves élus au début de l’année d’exercer le rôle du premier ministre, des ministres, du président de l’Assemblée et des députés de chaque classe. Sur place, les députés débattent de projets de loi qui sont ensuite sanctionnés par le directeur de l’école qui joue le rôle de lieutenant-gouverneur.